药学院是整合齐鲁工业大学的优势教育资源和山东省科学院的优质科研资源成立的科教融合学院药学院秉承“因材施教、个性化培养”的理念，采用“小班精培制”与“学业导师制”的教学模式，以培养创新型科学技术人才为牵引，充分的发挥“共性+特色”的专业课程教学体系优势，全面配套多层次奖助体系和多渠道国际交流培训，以高质量教学能力和多层次科研实践为依托，着力构建具备较强创新意识、科研思维和实践能力的高级复合型药学人才培育基地。紧随当今医药行业的发展的新趋势，药学院着力在现代药物生产、药物精细制造等特色领域发挥自身的科研和教学优势。
学院将研究生培养的导师制管理模式引入本科生教育阶段。学生从大一开始实行学业导师制，融入导师的研究团队参与课题研究、进行学术传承。有利于培育学生专业素养和科学精神，提高学生创新和实践能力，更好地规划职业生涯。
本科生前2年在学校进行通识教育与专业基础课程学习，后2年依托科研院所进行专业教育和实践教学，完成实习实训、毕业设计等教学环节。在科教融合的教育模式下，奠定学生的学术基础、激发创新思维、实现“教学相长”。
齐鲁工业大学在设置国家奖学金、国家励志奖学金、国家助学金、省政府奖学金、省政府励志奖学金等基本奖助学金之外，还为学生设立了校长奖学金、学习成绩奖学金、学习进步奖学金、素质拓展奖学金等特色奖助学金。此外，药学院单独设立了“英才计划奖学金”，学生奖助学金的覆盖率超过25%。
学院充分的利用科研院所的实践教学平台优势，构建全方位的药学专业综合实践体系。学院与鲁南制药、宏济堂制药、齐鲁制药、罗欣药业、蓝城检测等省内外有名的公司合作，邀请公司参与课程设置、开发、实习、实训等所有的环节。学院根据特定制药企业需求，进行“订单式”学生培养，形成以学生为主、以工程建设项目为驱动的实践教学模式，使学生获得良好的实践与训练，更好地适应行业需求。
药学院目前共有科教人员50人，其中博士46人，占92%；高级职称人员22人，占44%。聘请澳大利亚科学院院士、韩国科学技术院院士、海外泰山学者等作为特聘专家。教师队伍拥有享受国务院政府特殊津贴专家、山东省泰山学者专家等高层次学科带头人2人、博硕士导师22人，人才结构合理。拥有药物化学、药物分析、免疫药理、药剂学、生药学5个学科研究方向。
齐鲁工业大学（山东省科学院）药学院与韩国首尔国立大学、丹麦哥本哈根大学、澳大利亚弗林德斯大学和斯里兰卡卢哈纳大学等相关学院均建立了合作伙伴关系，为学生领略学科前沿、开拓国际视野、开展校外实习、出国交流深造等提供了有力保障。
学院承担国家自然科学基金、“十三五”国家重点研发计划、“十二五”国家科技支撑计划、国家863计划等项目150余项，获批总经费8000多万。
获得国家科学技术进步二等奖1项、山东省科学技术进步一等奖2项、山东省科学技术进步二等奖5项等国家级、省部级科技奖励总计20余项。发表学术论文500余篇，其中SCI收录200余篇。
申请专利100余项，其中PCT国际申请1项，授权专利70余项。获批国家实物标准56项。
本专业秉承“因材施教、知行合一”的教育方法的理念，以个性化培养为目标，采用小班制教学，实行学业导师制。主要有两大特色：一是“2+2”进阶式培养，前2年在大学学习基础课程和部分专业课程，后2年依托科学院完成专业课程、实习实训、毕业设计等教学环节；二是个性化定制式培养，由学业导师针对学生的发展目标、人生规划、优势特长等，与学生共同制定培养计划，并适时提供专业指导。
本专业针对国家医药行业对于高级复合型人才的重大需求，培养具备药物合成、药物分析、药物制剂等多方面专业素质的人才，毕业后可在医药企业、医院、科研院所、高等院校、食药监部门等单位就职，从事药物设计、研发、质量控制、流通与管理等专业方面技术方面的工作。本专业还可根据山东省大型制药企业的特定需求，进行“订单式”学生培养，多途径解决学生的就业问题。
药剂专业同样采用“2+2”进阶式培养模式。本专业以化学、中药、天然药物等药物制剂的生产与研发、质量控制为特色，配有完备的药品生产实验设备和先进的药物质量检验、制剂开发等科研创新条件，能够很好的满足片剂、胶囊剂、颗粒剂、口服液等各种剂型制备与分析的教学实践。
本专业以培养高素质、高水平、高技能等复合型人才为指导思想，重点培育能适应新时代发展的创新型药剂人才。
本专业毕业生就业领域遍布中外制药企业、科研院校、药监行政、医院等多个行业部门。近年来，学生考研率超过40%，毕业生就业率接近100%。
药学院目前下设药学和药物制剂两个科教融合专业。药学专业是2019年新启动的特色专业；药物制剂专业成立于2006年，是山东省高水平应用型立项建设专业，也是我校重点发展的特色专业。
2020年药学院以药学类专业（招生代码：1L）招生，今年共计招生120人，其中山东省内92人，省外28人，这中间还包括湖南8人、四川7人、江苏8人、海南5人。